MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli DH1 chromosome

Total Repeats: 13271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017625	CGC	2	6	6164	6169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017625	AAG	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017625	ATC	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017625	ATC	2	6	6239	6244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017625	CG	3	6	6715	6720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017625	GGGC	2	8	7628	7635	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017625	CTT	2	6	8368	8373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017625	CCT	2	6	8376	8381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017625	T	7	7	8429	8435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017625	GTA	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017625	CAA	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017625	TAC	2	6	8486	8491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017625	TCA	2	6	8517	8522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017625	TAC	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017625	ATCG	2	8	8553	8560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017625	AGA	2	6	8572	8577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017625	TCAC	2	8	14390	14397	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017625	TCA	2	6	14400	14405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017625	ATG	2	6	14450	14455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017625	TGA	2	6	16068	16073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017625	CAT	3	9	16101	16109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017625	GGC	2	6	16123	16128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017625	TGC	2	6	16149	16154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017625	A	8	8	16187	16194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017625	ACCTG	2	10	16281	16290	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017625	GCC	2	6	16763	16768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017625	TACT	2	8	16833	16840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017625	CTT	2	6	16843	16848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017625	TGG	2	6	17321	17326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017625	T	7	7	17330	17336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017625	CTTA	2	8	17339	17346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017625	CAA	2	6	17349	17354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017625	T	6	6	19875	19880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017625	CA	3	6	19903	19908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017625	A	6	6	19928	19933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017625	T	8	8	19938	19945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017625	GTC	2	6	20057	20062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017625	GGC	2	6	20183	20188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017625	TGC	2	6	20205	20210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017625	TGG	2	6	20232	20237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017625	TGC	2	6	20250	20255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017625	ATT	2	6	20321	20326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017625	AAGC	2	8	20399	20406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017625	TCA	2	6	20460	20465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017625	ATG	2	6	20543	20548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017625	A	6	6	20636	20641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017625	TGA	2	6	20703	20708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017625	CGG	2	6	20787	20792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017625	GGC	2	6	20900	20905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017625	GCA	2	6	20923	20928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017625	GTT	2	6	20968	20973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017625	TGG	2	6	21117	21122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017625	GGC	2	6	21193	21198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017625	TGGTG	2	10	21226	21235	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017625	ATG	2	6	21311	21316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017625	CTG	2	6	21350	21355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017625	ACC	2	6	21470	21475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017625	A	7	7	21487	21493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017625	TTAA	2	8	21722	21729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017625	TCA	2	6	21733	21738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017625	CAG	2	6	21741	21746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017625	ACC	2	6	21976	21981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017625	A	6	6	22064	22069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017625	GTT	2	6	22087	22092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017625	CGG	2	6	22113	22118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017625	GGC	2	6	22144	22149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017625	TGG	2	6	22160	22165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017625	ACT	2	6	22205	22210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017625	CGT	2	6	22243	22248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017625	TTG	2	6	22319	22324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017625	CTA	2	6	22356	22361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017625	TGG	2	6	22375	22380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017625	CAA	2	6	22559	22564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017625	ACG	2	6	23546	23551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017625	ACATAA	2	12	23620	23631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017625	TGA	2	6	26865	26870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017625	CGG	2	6	26876	26881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017625	ATT	2	6	26884	26889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017625	CCT	2	6	27352	27357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017625	A	7	7	27406	27412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017625	AAT	2	6	29862	29867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017625	TGA	2	6	29920	29925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017625	GA	3	6	30007	30012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017625	GCATC	2	10	30037	30046	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017625	TGC	2	6	30159	30164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017625	CCA	2	6	30197	30202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017625	TGT	2	6	30273	30278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017625	TTG	2	6	30310	30315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017625	CAC	2	6	30357	30362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017625	TAAA	2	8	30451	30458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017625	ACT	2	6	30800	30805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017625	CCG	2	6	30820	30825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017625	GTC	2	6	30831	30836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017625	GTG	3	9	30843	30851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017625	GTC	2	6	30852	30857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017625	AAC	2	6	30880	30885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017625	AC	3	6	30884	30889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017625	CCG	2	6	30902	30907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017625	CGGG	2	8	30916	30923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017625	AGA	2	6	30959	30964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017625	AAC	2	6	32975	32980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017625	T	8	8	33010	33017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017625	TGC	2	6	36539	36544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017625	ATGC	2	8	36556	36563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017625	T	7	7	38024	38030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017625	ATT	3	9	39828	39836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017625	ATT	2	6	39859	39864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017625	GTT	2	6	39915	39920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017625	TCC	2	6	39954	39959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017625	CGC	2	6	41874	41879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017625	CA	3	6	41964	41969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017625	AAG	2	6	43223	43228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017625	AGT	2	6	43237	43242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017625	CGTTT	2	10	43700	43709	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017625	T	6	6	43707	43712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017625	TAA	2	6	43751	43756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017625	TATG	2	8	45543	45550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017625	A	6	6	46829	46834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017625	GTATT	2	10	46870	46879	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017625	ATT	2	6	46951	46956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017625	AATT	2	8	46974	46981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017625	TA	3	6	46990	46995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017625	TTGAT	2	10	47046	47055	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017625	AT	3	6	47054	47059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017625	ATT	2	6	47092	47097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017625	T	7	7	47116	47122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017625	AATAG	2	10	47139	47148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017625	A	6	6	47155	47160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017625	ACA	2	6	47182	47187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017625	GGC	2	6	47486	47491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017625	GCC	2	6	47513	47518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017625	GAC	2	6	47527	47532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017625	T	6	6	47613	47618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017625	TAT	2	6	47638	47643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017625	AT	3	6	47687	47692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017625	TAA	2	6	47740	47745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017625	GCG	2	6	53394	53399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017625	CCG	2	6	53412	53417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017625	T	6	6	54922	54927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017625	GCG	2	6	56311	56316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017625	GCC	2	6	56325	56330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017625	CAA	2	6	56332	56337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017625	CGCTT	2	10	56354	56363	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017625	TGA	2	6	56407	56412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017625	TCT	2	6	56453	56458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_017625	AT	3	6	113954	113959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017625	TAAA	2	8	113963	113970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017625	TCAT	2	8	113980	113987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
285	NC_017625	ATC	2	6	114004	114009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_017625	ATA	2	6	114397	114402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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